UC San Diego Forscher erstellt CoralME, ein Werkzeug, das schnell Modelle Darmmikroben, aufzeigen, wie Ernährung Auswirkungen auf die Darmgesundheit und die Verbindung mikrobielle Veränderungen an entzündlichen Darmerkrankungen. UC San Diego researchers created coralME, a tool that quickly models gut microbes, revealing how diet affects gut health and linking microbial changes to inflammatory bowel disease.

Forscher an der UC San Diego haben CoralME entwickelt, ein neues Werkzeug, das schnell detaillierte Stoffwechselmodelle von Darmmikroben entwickelt und Wissenschaftlern ermöglicht, vorherzusagen, wie diese Organismen auf Nährstoffe und Diäten reagieren. Researchers at UC San Diego have developed coralME, a new tool that rapidly creates detailed metabolic models of gut microbes, enabling scientists to predict how these organisms respond to nutrients and diets. Das Tool generierte 495 Modelle von gemeinsamen Darmbakterien in einem Bruchteil der Zeit manuelle Methoden nehmen würde, aufdeckend, dass Low-Eisen oder Low-Zink-Diäten schädliche Mikroben begünstigen können, während bestimmte Makronährstoffe unterstützen vorteilhafte. The tool generated 495 models of common gut bacteria in a fraction of the time manual methods would take, revealing that low-iron or low-zinc diets may favor harmful microbes, while certain macronutrients support beneficial ones. Auf Daten der entzündlichen Darmerkrankung (IBD) wurde bei CoralME eine Verschiebung in der Darmchemie – wie z.B. ein höherer pH-Wert und niedrigere schützende kurzkettige Fettsäuren – festgestellt und spezifische mikrobielle Veränderungen mit der Krankheit verknüpft. Applied to inflammatory bowel disease (IBD) data, coralME identified shifts in gut chemistry—such as higher pH and lower protective short-chain fatty acids—and linked specific microbial changes to the disease. Die Ergebnisse könnten die Diagnose und personalisierte Behandlung für IBD und andere Mikrobiom-bezogene Bedingungen verbessern. The findings could improve diagnosis and personalized treatment for IBD and other microbiome-related conditions. Die Studie wurde am 20. November 2025 in Cell Systems veröffentlicht. The study was published on November 20, 2025, in Cell Systems.